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药用肉苁蓉的遗传多样性RAPD分析

发布日期:2021-10-18 12:10:00

崔光红,陈 敏,黄璐琦,肖苏萍,李达

(中国中医研院 中药研究所,北京100700

|摘要 目的 荒漠肉苁蓉Cktmche desracolr 和德赢vwin登录 Chtnhe afuknr 群体遗传多样性的研究,方法:对荒漠肉苁蓉2个野生居群和德赢vwin登录 4个野生居群进行RAID分析,利用POPGENE1.31版软件分析群体的遗传多样性,结果,荒漠肉苁蓉平均多态位点百分率47.37%.2个居群多志位点分别为39.47%和35.53%,平均Nef*基因多杆性为0.1358Shamm。多志性信总指数为0.307 2,基因分化系数 Gr0 2546,德赢vwin登录 平均多态位点百分率27.59%,各居群多态位点百分率从19.54%到25.295%,其中安地尔居群的最高25.29%,平均Na.基因多样性为0.0823Shamml。多志性信息指数为0.1258基因分化系数Gr0.1755,结论 荒漠肉苁蓉和德赢vwin登录 在居群间均一定的分化,荒漠内苁蓉的遗传多样性明基高德赢vwin登录 ,已明基分化成2个生态型

|关键词 荒漠肉苁蓉管花肉其荐:RAPDA遗传多样性

1中图分类号]S567 |文献标识码A[文章编]1001-53031 30008-072-04


肉苁蓉为列当科肉苁蓉属寄生植物,又名大芸属于名贵中药材,我国肉苁蓉药材的主要来源植物为荒漠肉苁蓉 Ciranhe dosrtinla Y.C.Ma 和德赢vwin登录 C.nbulsa(Schenk)R.Wihd',荒漠肉苁蓉的寄主植物为梭梭和白梭梭,主要分布在内蒙的阿拉善盟、新疆北部、青海、甘肃等地 荒漠肉苁蓉分布与寄主植物基本同步,而德赢vwin登录 在我国仅分布于新疆山以南塔克拉玛干沙漠周围各县,其分布与寄主柽柳属植物不完全同步,其他地区如新疆北部,甘肃、青海、宁夏、内蒙古、陕西等地的柽柳属植物均不寄生德赢vwin登录 ”,由于近年来对肉苁蓉需求量的急剧增长,造成对其资源的灭绝式采挖,野生肉苁蓉资源已退缩到仅有的几个主产区。两者均已列为我国濒危保护植物物种”,其中荒漠肉苁蓉已收录入CIIES附录甲。

经过数年的研究,肉苁蓉人工繁育研究已获得成功,正处于大面积推广种植阶段,然而,在产业化生产时如何防止肉苁蓉物种的衰退,以及如何尽快恢复有限的野生居群,保存珍贵的野生种质资源,是实现其可持续利用的关键,而对于肉苁蓉的保护遗传学研究还是一片空白,本研究运用RAPD技术对荒澳肉苁蓉的2个和德赢vwin登录 的4个野生居群进行研究,分析了两者遗传多样性的差异,以期为保护肉苁蓉一名贵中药提供重要的实验遗传学依据。

1 材料和方法

1.1 材料 荒漠肉苁蓉采自新疆吉木萨尔县和内蒙古阿拉善盟的吉兰太地区,德赢vwin登录 居群自新疆民丰县和于田县,民丰县为目前德赢vwin登录 产量最大的地区,分布有密度最大,自然林相对较为完整的群落。采样点民丰县安迪尔,萨吾则克,牙通古孜和于田县大河沿均为主产区,分别位于安迪尔河,叶亦克河,牙通古孜河以及克里雅河的下游,居群间相距50km以上,各居群均随机取样1930个体样品置于硅胶中快速干燥后,用于DNA提取(表1)。

1 德赢vwin登录 和荒漠肉苁蓉取样的居群及产地

품하

采样数目

采集地点

거有有

吉本萨尔

30

新疆吉本萨尔县

吉兰太

30

内蒙阿拉善盟

管花内队蓉 安迪尔

22

民县安迪尔农场

萨西则克


民本县萨吾则克

通古斯

23

民县牙通古斯

河油

61

于田县大河沿

1.2 DNA的提取 总INA 提取方法用高盐,低HINA样品经分光光度计检测INA模板的浓度用1%的琼脂糖凝胶电泳EB染色,紫外灯下观察照相,电泳INA 带清晰,拖尾较少的用于BAPD分析。

1.3 RAPD 引物的筛选 由于经实验发现同一引物 2 结果与分析对荒漠肉苁蓉和德赢vwin登录 二者同时扩增的效果不理想,因此各自独立进行引物的筛选,用上海生工生物技术公司150条随机引物10bp).25L的反应体系进行扩增筛选;每条引物用2个居群的模板再加1个灭菌双蒸水作空白对照 得到对荒漠肉苁蓉扩增条带清晰、多态性强,重复性好的10条引物,S490,S1101,81 131,51 137.51 165,81 218,S1 222,52 015,82 112,82 140.德赢vwin登录 的10条引物:S1 141,S1 146,S1 183,81 208,S1 500,82 032,82 042,52 052,82 059. S2.155. 

1.4 PCR扩增及产物检测 用筛选好的引物分别对荒漠肉苁蓉和德赢vwin登录 模板INA进行PCR扩增。基因组DNA 根据所测浓度稀释至50mg“L”'作为模板,反应总体积为25円,其中IOxPCR Bufer 2.5PL,Mg2*1.574,Taq(5 U*14."1)0.2/4L,dNTP Mixdure (各2.5mM14.5PM Primer 1PL,模板INA 1円。 灭菌双蒸水18.8円,上述ICR扩增液均为上海Srgpn的产品。扩增在PIC-100扩增仪上进行,扩增程序为94℃预变性5min后进行40个循环,每个循环包括94 ℃45.34 ℃I min72 ℃1min 30x最后在72℃延伸5min,扩增产物用2.0%的琼脂糖凝胶(含EB)在IXTAE 缓冲液中电泳,SYNGENE型凝胶成像系统下观察、拍照。

1.5 数据的统计和分析 电泳图谱中根据分子量标准对照反应产物在胶上的对应位置,估计扩增产物分子量的大小,有带的记为1,无带的记为0.形成0V1矩阵图输入计算机 利用POPGENE32计算各个居群的多态位点百分率(PPL),Ner.基因多样性指数(H),Shannon'。多态性信息指数(1),基因分化系数(Ga),基因多样性(Hr),居群内基因多样性(Hs.Ne'(1978)遗传一致度(1)和遗传距离(D),并采用UPGMA 法进行聚类分析。

2.1 肉苁蓉的遗传多样性 所有样品均得到分子量范围在2002200bp的条带(图1,2)。荒漠肉苁蓉2个居群60个样品共检测到76个位点,其中36个为多态位点,占47.37%.H-0.135 8./-0.207 2.其中吉木萨尔的IPL39.47%,吉兰太的为35.53%。H分别为0.09530.1070,1分别为0.15120.1637.德赢vwin登录 4个居群86个个体共检测到87个位点,其中24个为多态性位点 占27.59%.H-0.0848./-0.127 8PPL最高的是安迪尔25.29%,萨吾则克和牙通古斯的较低(均为19.54%)。H0.062 1-0.0800.10.095 0-0.1216HI的 大小与各居群PPL的大小趋势一致,各项系数均是安迪尔的最大,大河沿的次之,在PH.相同的情况下,萨吾则克的H0.0641和/-0.0970稍高于牙通古斯的0.06210.095 0(表2)。

            image.png

1-10.吉兰太样品:11-20.吉木萨尔样品

M-INLA MMu do( 200-2 000 lp)

image.png

2 德赢vwin登录 部分样品的RAPD扩增请带,引物S20421-30.新疆安尔样品 -NA Mado300-2 000 1g

2 荒漠肉苁若和管花肉苁吞居群的遗传多样性

居#

个体数

总位点数

多态位点数

多态位点百分率

Na.基因多样性

Shnaal,指数

荒漠肉苁蓉 吉木萨尔

30

A

T

39.47

0.053

0.1512

吉兰太


76

35.53

0.1070

0.1637

总计

60

76

47.37

0.1358

0.307.2

德赢vwin登录 安迪尔

0

28

22

25.29

0.000

0.216

吾期克

22

K7

0

19.54

0.0641

0.970

牙通古斯

23

87

0

19.54

0.021

0.95.0

大河沿

19

87

8

30.69

0 990 0

0.98.6

总计

86

87


27.59

0.023

0.1258

 

2.2 肉苁蓉的遗传变异分析 根据遗传多样性水平在居群内(Hs),居群间的分化(Dsr)和居群间遗传差异在总遗传差异中所占的比例(Gr)可知:荒漠肉苁蓉的总基因多样度Ht-0.1358,其中压-0.1012Gr0.2546.德赢vwin登录 Hr0.0822.其中Hs-0.0678Gr0.1755(表3)。上述结果表明居群间均有一定程度的遗传变异,荒漠肉苁蓉居群间变异占总变异25.46%,德赢vwin登录 的居群间变异占总变异的17.55%。

3 荒漠肉苁蓉和德赢vwin登录 的遗传变异分析




Gr

营询库苁蓉

平均值

0.1358

0.012

0.2546


标准差

0.0354

0@22


管花内苁蓉

平均值

0.022

0.0578

0.755


标准差

0.0252

0.0074


2.3 肉苁蓉居群间的遗传距离和聚类分析 荒漠肉苁蓉2个居群的遗传距离为0.0800,遗传一致度为0.9231

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