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基于网络药理学和分子对接探讨肉苁蓉苯乙醇总苷对肝细胞癌的潜在分子机制(三)

发布日期:2021-12-16 11:33:00

肝细胞癌 肉苁蓉苯乙醇总苷

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2.4 PPI网络构建及分析

CPhGs治疗HCC的靶点蛋白PPI网络,见图3A,该网络涉及173个节点,2202条边。度值中位数为20,根据度值大于中位数2倍筛选出核心网络蛋白29个,见图3B,包括ALBAKT1EGFRMAPK1IGF1SRCCASP3MMP9HRASHSP90AA1MAPK8ESR1MMP2RHOAMAPK14ANXA5CATMDM2KDRPIK3R1CDC42MAP2K1STAT1GRB2ARIL2NOS3IGF1RJAK2。以上靶点在PPI网络中的位置,表明其在CPhGs 治疗HCC中可能发挥重要作用。

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3A CPhGs治疗HCC潜在作用靶点之间的相互作用网络

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2.5GO分类富集分析和KEGG通路富集分析

将筛选出的29个关键靶点进行 GOKEGG 富集分析,得到生物过程(Biological ProcessBP65条,主要包括蛋白质磷酸化,细胞增殖、迁移、凋亡,肾上腺素信号通路等:细胞组成(Cellular ComponentsCC18条,主要与细胞质,细胞间连接,细胞内外基质等有关;分子功能(Molecular FunctionMF23条,主要与蛋白激酶活性、蛋白质结合、酶结合等有关,见图4,以上数据P值均小于0.05

通过KEGG 富集得到92条信号通路(P0.05),主要涵盖癌症信号通路(hsa05200Pathways in cancer)、癌症蛋白聚糖通路(hsa05205Proteoglycans in cancer)、PI3K-Akt信号通路(hsa04151PI3K-Akt signaling pathway)、RAS信号 通路(hsa04014Ras signaling pathway)、FoxO 信号通路(hsa04068FoxO signaling pathway)、血管内皮生长因子信号通路(hsa04370VEGF signaling pathway)等,排名前20的通路,见图5


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